现任深圳理工大学算力微电子学院副院长、深圳理工大学附属中学（筹）校长。她同时担任中国科学院深圳先进技术研究院研究员、先进集成技术研究所副所长、汽车电子研究中心主任。

李慧云于2006年获得英国剑桥大学计算机系博士学位，同年加入中国科学院深圳先进技术研究院。她长期从事高性能集成电路芯片设计、自动驾驶感知决策控制等领域的研究，是国务院政府特殊津贴获得者、广东省科技领军人才。李慧云主持承担了国家863计划课题、国家自然科学基金等数十项科研项目，在IEEE Transactions等国际期刊及会议上发表论文200余篇，并先后获得深圳市科技进步一等奖、广东省科技进步二等奖、吴文俊人工智能科学技术奖等多项荣誉。