在课程体系上，“融合共享”的理念更加凸显。深实高中园结合国家教育改革方案，以深圳实验学校丰厚的教育资源为依托，努力实施构建科学完备的课程体系。学校创造性设置“1+N”课程模式——“1”即统一的国家课程，校区独立，分层授课，全员必修；“N”即个性化的融合课程，包括模块分类课程、素养活动课程、创新拔尖课程、卓越荣誉课程。从基础分层课程到卓越荣誉课程，五阶课程融合授课。

深实高中园将结合高考改革方案，遵循教育规律，科学实行以行政班为基础的走班制教学。学生在高一入学后将进行第一次分班：第一层次为“创新卓越班”，第二层次为“特色实验班”，第三层次为“学科重点班”。

模块分类课程由基础学科课程和综合类课程两大类组成，学科课程为模块自选，综合课程为全员必修，将面向全体学生，融合选修与必修，兴趣与基础，常规、专项与拓展等多种模式，给予学生充分的选择权利，践行个性化培养。